Paralelización

Parcialmente en agradecimiento a Revolution Analytics por haber concedido una subvención a las III Jornadas de usuarios de R voy a discutir en esta entrada cómo paralelizar bucles usando los paquetes foreach y doMC desarrollados por dicha empresa.

El paquete foreach contiene, esencialmente, una única función, foreach, que, en su forma más básica, permite ejecutar bucles con una sintaxis un tanto peculiar:

foreach( i = 1:3 ) %do% log( i )

Volveré sobre algunas operaciones interesantes y bastante útiles que permite realizar esta función porque, de todas ellas, hoy me ocuparé sólo de una: la que abre la puerta de una manera sencilla a la paralelización de bucles.

Tengo acceso a una máquina que, aunque anda un poco corta de memoria, cuenta con ocho CPUs. Tenía unas simulaciones bastante pesadas que correr y quise aprovechar su naturaleza perfectamente paralelizable. Y, de paso, hacer con R lo mismo por lo que he visto a un consultor de SAS cobrar a razón de 3.000 dólares diarios.

En el fondo, es una trivialidad. Supongamos que la función que implementa la simulación se llama foo. Habitualmente, haríamos