Estadística

Dos motivos me han tenido missing estas últimas semanas. Uno es una estancia en la Universidad de Santa Catalina del Burgo de Osma. Oportunamente ubicada en las estribaciones de la muy generosa en caldos de calidad Ribera del Duero, ha sido reconvertida a la sazón en un hotel propicio para la evasión y la agrafía.

El segundo es que en horas intempestivas he estado purgando de missings unas matrices enormes y de la, se conoce, mayor trascendencia. Es un asunto delicado, jamás bien resuelto, para el que el paquete [VIM](http://cran.r-project.org/web/packages/VIM/index.html) puede proporcionar ayuda. Sobre todo en los aspectos gráficos.

Muchos cuidamos de nuestro ordenador casi como una mascota: le ponemos un nombre (a menudo escribo desde tiramisu), le hacemos algo de mantenimiento, etc. Hay quienes, incluso, decoran sus máquinas con pegatinas.

Pero llega un momento en que hay que comenzar a tratar a las máquinas no tanto como mascotas sino como rebaños. Desde una pantalla aneja a esta en la que escribo estoy manejando un clúster de más de 200 GB y 50 núcleos distribuido en varias máquinas que ni sé dónde están. Además, solo espero que crezca. Ya no cuido de una mascota; cuido de un rebaño.

Lo que escribí hace un par de días sobre procesos puntuales, ahora me doy cuenta, podía haberse resuelto con nuestro viejo amigo glm.

Ejecuto el código del otro día y obtengo (para un caso nuevo)

          mu       alfa verosimilitud delta
    1  0.4493158 0.50000000      340.6141     1
    2  0.2675349 0.40457418      307.3939     2
    3  0.1894562 0.28917407      293.4696     3
    4  0.1495654 0.22237707      287.0784     4
    5  0.1243791 0.18079703      281.3900     5
    6  0.1142837 0.14913172      284.9227     6
    7  0.1217504 0.12150745      288.5448     7
    8  0.1214365 0.10424818      289.3282     8
    9  0.1204605 0.09148817      290.9081     9
    10 0.1315896 0.07857330      295.3935    10</code>

que significa que el parámetro óptimo es delta = 5, mu = 0.124 y alfa = 0.18.

Ahora hago

    cuantos.previos <- function(i, muestra, delta){
      indices <- Filter(function(x) x < i & x > i - delta, 1:n)
      cuantos <- sum(muestra[indices])
    }

    fit.glm <- function(delta){
      prev <- sapply(1:length(muestra),
                     cuantos.previos, muestra, delta)
      dat  <- data.frame(muestra = muestra, prev = prev)

      res.glm <- glm(muestra ~ prev, data = dat,
                     family = poisson(link = "identity"))
      c(delta, res.glm$coefficients, summary(res.glm)$aic)
    }

    res.glm <- sapply(1:10, fit.glm)
    res.glm <- as.data.frame(t(res.glm))
    colnames(res.glm) <- c("delta", "mu", "alfa", "aic")

y obtengo

Tengo una serie de datos que se parecen a lo que cierta gente llama procesos puntuales y que se parecen a los que se introducen (muuuuy prolijamente) aquí. Gráficamente, tienen este aspecto:

Sobre un determinado periodo de tiempo (eje horizontal) suceden eventos y los cuento por fecha. Pero no suceden independientemente (como si generados por un proceso de Poisson) sino que tienden a agruparse: el que suceda un evento tiende a incrementar la probabilidad de que suceda otro poco después. El proceso, en una mala traducción, se autoexcita.

Partamos el tiempo en, p.e., días y contemos una serie de eventos que suceden en ellos. Es posible que esos recuentos se distribuyan según un proceso de Poisson de parámetro $latex \lambda$, que es un valor que regula la intensidad.

Si los días son homogéneos, i.e., no hay variaciones de intensidad diaria, estimar $latex \lambda$ (por máxima verosimilitud), es tan fácil como calcular la media de los sucesos por día. Pero puede suceder que la intensidad varíe en el tiempo (p.e., se reduzca los fines de semana). O que fluctúe de cualquier manera. O que haya periodos de gran intensidad y otros de calma. Es decir, que el proceso no sea homogéneo y que $latex \lambda$ varíe en el tiempo.

[…] con algo llamado aritmética política en el siglo XVII […]

El resto (son apenas ocho hojas), tenéis que leerlo (porque os intriga, ¿verdad?) aquí.

Una red bayesiana es algo de lo que ya hablé (y que me está volviendo a interesar mucho últimamente). En esencia, es un modelo probabilístico construido sobre un grafo dirigido acíclico.

Que, a su vez, es algo parecido a

que es un grafo (obviamente), dirigido (tiene flechas) y acíclico porque siguiéndolas no se llega nunca al punto de partida. Se puede construir modelos probabilísticos sobre ellos. Basta con definir para cada nodo $latex x$ la probabilidad condicional $latex P(x|A(x))$, donde $latex A(x)$ son sus padres directos. Con estas probabilidades condicionales (y un poco de esfuerzo) se puede construir la función de probabilidad completa, $latex P(x_1, \dots, x_n)$.

El INE está realizando una convocatoria para cubrir varias plazas en el Cuerpo Superior de Estadísticos del Estado.

Si quieres presentarte mira el temario sobre el que te examinarán. Si no has estado al tanto de lo que ha ocurrido en el mundo de la estadística en los últimos 30 o 40 años o no sabes programar, no te preocupes: no entra.

Eso sí, si tienes diez publicaciones estadísticas de alto nivel en los temas relevantes… no te valen para nada. Si estudiaste en Columbia con Gelman o en Cambridge con Spiegelhalter, tampoco te va a valer de mucho lo que aprendiste con ellos.

Hace unos días alguien me pasó una fórmula que tiene una pinta no muy distinta de

$$ p = \frac{p_1 p_2 \cdots p_N}{p_1 p_2 \cdots p_N + (1 - p_1)(1 - p_2) \cdots (1 - p_N)}$$

alegando que era una aplicación de métodos bayesianos (para estimar la probabilidad de algo combinando distintos indicios). Pero no está en mi libro (¿y en el tuyo?). El hilo (y varios correos) me condujeron a esto y de ahí, a través de referencias de referencias, a Combining Probabilities. Donde todo está muy bien explicado.

Planteas un modelo tal como resp ~ treat y no encuentras diferencia significativa. O incluso puede ser negativa. Globalmente.

La pregunta es, con el permiso del Sr. Simpson (o tal vez inspirados por él), ¿existirá alguna región del espacio en la que el tratamiento tiene un efecto beneficioso? Puede que sí. Y de haberla, ¿cómo identificarla?

De eso hablo hoy aquí. E incluyo una protorespuesta.

Primero, genero datos:

n  <- 20000
v1 <- sample(0:1, n, replace = T)
v2 <- sample(0:1, n, replace = T)
v3 <- sample(0:1, n, replace = T)

treat <- sample(0:1, n, replace = T)

y <- v1 + treat * v1 * v2
y <- exp(y) / (1 + exp(y))
y <- sapply(y, function(x) rbinom(1,1,x))

dat <- data.frame(
    y = y,
    treat = factor(treat), v1 = v1,
    v2 = v2, v3 = v3)

Como puede apreciarse, solo las variables v1 y v2 (y no v3) interaccionan con el tratamiento: solo en la región donde v1 = v1 = 1 el efecto del tratamiento es positivo.