R

Voy a impartir un curso básico de R en Madrid. El curso es presencial (no habrá vídeo, retransmisión en streaming ni similares), gratuito (aunque mira las letra pequeña del final) no reglado, por lo que no se experidirán certificados, ANECAs o papeles de ningún tipo. Se trata de un curso de introducción a R desde cero en cuatro sesiones de tres horas los martes (24 de febrero y 3, 10 y 17 de marzo) de 18:00 a 21:00. El programa de las sesiones es: ...

Pregunta Antonio Sánchez Chinchón cómo mejorar la parte menos vistosa e imaginativa de esto, es decir, el código. Él, y muchos diríamos que correctamente, autocritica el uso de eval + parse para plagar el namespace de funciones. La respuesta está en la recurrencia. He aquí mi versión del código: library(ggplot2) library(gridExtra) nrows <- 6 coefs.a <- runif(min=1, max=50, nrows) coefs.b <- runif(min=1, max=50, nrows) foo.a <- sample(c(sin, cos), nrows, replace = TRUE) foo.b <- sample(c(sin, cos), nrows, replace = TRUE) foo <- function(x, a, b){ if(a == 1 || b == 1) return(foo.a[[a]](coefs.a[a] * x)) if(b == a) return(foo.b[[a]](coefs.b[a] * x)) foo(x, a-1, b) + foo(x, a-1, b-1) } vplayout = function(x, y) viewport(layout.pos.row = x, layout.pos.col = y) opts=theme(legend.position="none", panel.background = element_rect(fill="gray95"), plot.background = element_rect(fill="gray95", colour="gray95"), panel.grid = element_blank(), axis.ticks=element_blank(), axis.title=element_blank(), axis.text =element_blank()) grid.newpage() jpeg(file="AddingWaves.jpeg", width = 1800, height = 1000, bg = "gray95", quality = 100) pushViewport(viewport(layout = grid.layout(nrows, 2*nrows-1))) for (i in 1:nrows) { for (j in 1:i) { print(ggplot(data.frame(x = c(0, 20)), aes(x)) + stat_function(fun = function(x) foo(x, i, j), colour = "black", alpha=.75)+opts, vp = vplayout(i, nrows+(2*j-(i+1)))) } } dev.off() El resultado es ...

Ya conté que participo (como profesor) en el Experto en Data Science de la U-tad. Voy a copiar aquí los ejercicios que propuse en la asignatura de preparación de datos con R. Por si alguien les quiere hincar el diente. En lo que sigue he eliminado algunos detalles que no vienen a cuento. He dejado el resto. Son así: Los ejercicios tienen que resolverse individualmente. No son sencillos: parte de ellos están inspirados en problemas prácticos reales. Por eso puedes ayudarte de cualquier tipo de instrumento (Google, blogs, libros, etc.) que estaría a tu alcance en tu trabajo. Eso sí, en las soluciones que envíes, indica los recursos que utilices y deja clara cuál es tu aportación en cada caso. ...

Me entero en la página del grupo de usuarios de R de Sevilla de dos cosas: de que Romain François hablará sobre dplyr y de lo que esconde bajo el capó y que Francisco Viciana demostrará el uso del paquete pxR en la próxima reunión del grupo. ¡Quién pudiera asistir!

Un ejemplo sencillo. Tengo un programa que contiene, por ejemplo, una consulta tal que query <- "select * from mitabla where country = 24 and year = 2014" Hay gente sumamente diligente, con una enorme capacidad de trabajo y con vocación de hormiguita que en mil ejecuciones distintas (distinto país, distinto año) del código anterior sería capaz de editar la consulta a mano. Probablemente usando el block de notas. Esa gente, que además suele madrugar mucho, siempre me ha dado cierta envidia. No sé por qué. ...

El jueves pasado y durante un breve receso de mi gripe, me entrevistaron en Canal Extremadura Radio. Durante una hora larga (que luego hubo que recortar a los 30 minutos que dura el programa de divulgación científica Principio de Incertidumbre) hablé de estadística, big data y R con Jorge Solís Bejarano. A quien tengo que agradecer, primero, que contase conmigo; pero además y sobre todo, lo bien documentado que estuvo (lo cual me lleva a pensar que habrá que estar atentos a otras grabaciones de su programa). ...

Tenía en mente escribir estas líneas desde hace un tiempo. La reciente noticia de la adquisición de Revolution Analytics por parte de Microsoft la ha adelantado, como mucho, unos pocos días. S, el lenguaje del que R es una implementación libre, vivió su ciclo propietario completo: nació en los laboratorios Bell, creció con Insightful, se reprodujo (R fue su vástago) y creo que ha muerto sin pena ni gloria en manos de Tibco. Como casi cualquier otro producto similar. ...

Preguntaba el otro día Emilio Torres esto en R-help-es. Resumo la pregunta. Se trata de una simulación de unos datos y su ajuste mediante una regresión logística para ver si los coeficientes obtenidos son o no los esperados (teóricamente y por construcción). El código de Emilio (cuyos resultados no podemos reproducir porque no nos ha contado qué similla usa) es logisticsimulation <- function(n){ dat <- data.frame(x1=sample(0:1, n,replace=TRUE), x2=sample(0:1, n,replace=TRUE)) odds <- exp(-1 - 4 * dat$x1 + 7*dat$x2 - 1 *dat$x1* dat$x2 ) pr <- odds/(1+odds) res <- replicate(100, { dat$y <- rbinom(n,1,pr) coef(glm(y ~ x1*x2, data = dat, family = binomial())) }) t(res) } res <- logisticsimulation(100) apply(res,2,median) ## (Intercept) x1 x2 x1:x2 ## -1.0986123 -18.4674562 20.4823593 -0.0512933 Efectivamente, los coeficientes están lejos de los esperados, i.e., -1, -4, 7 y 1. ...

En todos mis Linux, desde el principio de los tiempos, R guardaba los paquetes en /usr/lib/R/library /usr/lib/R/site-library (¡a veces y no sé por qué!) /usr/local/lib/R/site-library Bajo /usr/lib deberían instalarse solo aquellos que vienen de serie con la instalación de R (o que se instalan usando el sistema de actualización de paquetes de la distribución de Linux) mientras que bajo /usr/local vivirían los instalados posteriormente por el usuario (véase esto). Por supuesto, para escribir /usr/local/lib/R/site-library hacen falta permisos de superusuario y los paquetes ahí instalados están disponibles para todos los usuarios de la máquina. Pero de un tiempo a esta parte y por culpa, creo, de RStudio (tanto en versión de escritorio como de servidor), se me han comenzado a instalar paquetes en ~/R, bajo mi directorio personal. ¡Anatema! ...

Creo que todos sabéis la historia de las admisiones de la Universidad de Berkeley y la paradoja de Simpson. Con palabras, muchas palabras, está contado, por ejemplo, aquí. Y si buscáis ubc admissions simpson en Google la encontraréis también en modo --verbose en muchos más sitios. En R puede resumirse en library(reshape2) library(plyr) data(UCBAdmissions) raw <- as.data.frame(UCBAdmissions) dat <- dcast(raw, Gender + Dept ~ <a href="http://inside-r.org/packages/cran/AdMit">Admit) mod.0 <- glm(cbind(Admitted, Rejected) ~ Gender, data = dat, family = binomial) mod.1 <- glm(cbind(Admitted, Rejected) ~ Gender + Dept, data = dat, family = binomial) Echad un vistazo a los coeficientes de Gender en ambos modelos y veréis. ...